Un homme reçoit une dose de vaccin contre le coronavirus Covid-19 dans un centre social du quartier populaire La Gavotte Peyret de Septeme-Les-Vallons (Boques-du-Rhône) le 12 janvier 2022. CLEMENT MAHOUDEAU / AFP
La variante Omicron est définitivement un OVNI. Cet avatar du virus SARS-CoV-2, dont l’influence mondiale est devenue quasi hégémonique, est bien connu pour se différencier de ses prédécesseurs par ses nombreuses mutations. Lorsqu’elle a été détectée en Afrique du Sud en novembre 2021, dans sa version BA.1 (celle qui a dévasté l’Europe en décembre), elle avait déjà la cinquantaine, à comparer à la souche historique de Wuhan. Depuis, les versions ultérieures successives en ont acquis de nouvelles, notamment BA.2, et maintenant BA.4 et BA.5. Or, ces derniers “seront ultra-majoritaires dans environ trois semaines en France”, selon Mahmoud Zureik, professeur d’épidémiologie et de santé publique à l’université de Versailles-Saint-Quentin (Yvelines).
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Les chercheurs découvrent lentement comment, grâce à ces mutations, Omicron échappe à nos défenses immunitaires. “Omicron est clairement une variante à part. Dans l’arbre généalogique du virus SARS-CoV-2, il provient d’une branche très éloignée des autres variantes”, a déclaré le professeur Olivier Schwartz, responsable de l’unité virus et immunité à l’Institut Pasteur de Paris. , par exemple, n’est pas du tout détecté par les anticorps des personnes double-vaccinées qui n’ont pas reçu de troisième dose, et est très mal détecté par les anticorps de ceux qui ont été infectés par la souche Wuhan. infectés par Omicron reconnaissent très peu des variantes ci-dessus.
Les personnes infectées par BA.1 peuvent-elles être infectées par les dernières versions d’Omicron, telles que BA.5 ? Trois études récentes éclairent cette question. Une étude sud-africaine, non revue par des pairs et publiée le 24 avril, suggère que les anticorps de personnes non vaccinées infectées par BA.1 neutralisent BA.4 et BA.5 environ 7,5 fois moins bien. Il est clair qu’une personne infectée par Omicron en début d’année n’est pas totalement protégée contre le risque de réinfection par BA.4 ou BA.5, surtout si elle n’est pas vaccinée.
Différentes sous-variantes
Cependant, les réinfections avec BA.4 ou BA.5 sont-elles plus fréquentes qu’avec BA.1 ? Je ne suis pas sûr. “Environ 15% des cas BA.4 et BA.5 enquêtés ont fait état d’une précédente infection par le SRAS-CoV-2”, écrit Santé publique France le 17 juin dans son analyse de risque des variants. Cela correspond à “un taux de réinfection similaire aux cas de BA.1” constaté par l’agence.
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Une autre étude, publiée dans la revue Nature le 17 juin, s’est penchée sur les anticorps produits après infection par BA.1 chez des personnes triples vaccinées avec Coronavac (un vaccin chinois à base de virus inactivés). Résultats : Ces anticorps neutralisent de plus en plus mal les différents sous-variants d’Omicron, au fur et à mesure qu’ils se succèdent. « Par conséquent, cette étude pose la question de la pertinence de développer des vaccins qui ne ciblent que la sous-variante BA.1 d’Omicron », a déclaré Mahmoud Zureik.
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